Prima di tutto, dato che la ruggine non è andata via completamente, ti sconsiglio di passare direttamente l'antiruggine: funziona bene come prevenzione, ma è poco efficace se la ruggine è già presente.
Sulle zone dove si vede ancora, usa prima un convertitore di ruggine: è un prodotto che reagisce chimicamente con la ruggine e la trasforma in un composto stabile e inerte, creando una superficie pronta per la verniciatura.
Dopo di che hai due opzioni: verniciare direttamente con uno smalto (se il convertitore che usi funge anche da primer, cosa che molti prodotti moderni dichiarano esplicitamente), oppure passare prima uno strato di antiruggine e poi lo smalto, che è la soluzione più robusta soprattutto per superfici esterne.
Per quanto riguarda le parti bucate, personalmente, dopo aver passato il converti ruggine, incollerei (o forse meglio con i rivetti) sul retro una lastra di metallo e poi nella parte anteriore riempirei con uno stucco per metalli.